Yogyakarta pukul 23.28.
Kutoarjo pukul 00.22.
Kebumen pukul 00.45.
Kroya pukul 01.22.
Purwokerto pukul 01.50.
Cirebon pukul 03.48.
Jatinegara pukul 06.20.
Sedangkan untuk keberangkatan dari Gambir, Kereta Api Manahan memiliki jadwal tersendiri. Adapun jadwal keberangkatan dari Gambir adalah sebagai berikut.
1. Jadwal Kereta Api Manahan Nomor KA 80